茯苓采收期的確定，發現窖頂土龜裂，說明地下茯苓正在生長，用土將裂縫填好，經過一段時間不再裂縫，說明地下茯苓已成熟即可挖窖采收；不同栽培方法茯苓采收期不同，應隨熟隨采。

采收后先將鮮茯苓除去砂土，置于鋪好稻草上，大個的鋪放2層，小個的鋪放3層。稻草與茯苓相間逐層鋪放，最上層鋪蓋稻草，四周也用稻草封嚴，使其發汗。

第一個星期每天取出茯苓擦其表皮水珠，再堆置發汗；

第二個星期每2－3天翻動一次。當茯苓表皮長出白色絨毛狀菌絲時，取出擦干凈，表皮呈皺縮黑褐色，置涼爽干燥處陰干，即為成品“個苓”；用刀剝下的黑色外皮稱“茯苓皮”。

將茯苓切成塊片，皮下赤紅色的部分稱“赤茯苓”；菌核內部由色、細致、堅實的部分稱“白茯苓”；白茯苓中心有一木心稱“茯神木”。

不同規格的商品分別加工曬干。每窖的產量約10公斤左右。